Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd3Q8K2F0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd3Q8K2F0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms