Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nek9Q8K1R7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Nek9Q8K1R7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nek9Q8K1R7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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