Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nupl2Q8CIC2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms