Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NgefQ8CHT1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms