Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Arhgap29Q8CGF1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Arhgap29Q8CGF1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Arhgap29Q8CGF1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgap29Q8CGF1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgap29Q8CGF1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgap29Q8CGF1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arhgap29Q8CGF1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms