Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brf1Q8CFK2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brf1Q8CFK2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brf1Q8CFK2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brf1Q8CFK2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brf1Q8CFK2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brf1Q8CFK2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brf1Q8CFK2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brf1Q8CFK2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brf1Q8CFK2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brf1Q8CFK2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brf1Q8CFK2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brf1Q8CFK2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brf1Q8CFK2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brf1Q8CFK2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brf1Q8CFK2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brf1Q8CFK2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brf1Q8CFK2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brf1Q8CFK2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brf1Q8CFK2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brf1Q8CFK2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brf1Q8CFK2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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