Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFF0

Parp11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp11Q8CFF0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms