Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Hpf1Q8CFE2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Hpf1Q8CFE2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Hpf1Q8CFE2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Hpf1Q8CFE2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Hpf1Q8CFE2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Hpf1Q8CFE2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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Hpf1Q8CFE2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Hpf1Q8CFE2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hpf1Q8CFE2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Hpf1Q8CFE2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Hpf1Q8CFE2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Hpf1Q8CFE2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Hpf1Q8CFE2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Hpf1Q8CFE2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Hpf1Q8CFE2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Hpf1Q8CFE2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hpf1Q8CFE2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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