Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms