Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

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Length 866 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc178Q8CDV0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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