Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp1Q8C8U0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms