Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930504O13RikQ8C5Z9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms