Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnfsfm13Q8BXS2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsfm13Q8BXS2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms