Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Pggt1bQ8BUY9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms