Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR90

UPF0600 protein C5orf51 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BR90 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BR90 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BR90 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BR90 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BR90 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BR90 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BR90 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BR90 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BR90 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BR90 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BR90 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BR90 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BR90 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BR90 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BR90 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BR90 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BR90 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BR90 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BR90 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BR90 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BR90 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8BR90 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BR90 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BR90 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BR90 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BR90 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BR90 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BR90 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BR90 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BR90 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BR90 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BR90 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BR90 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BR90 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BR90 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BR90 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BR90 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8BR90 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BR90 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BR90 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BR90 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BR90 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BR90 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BR90 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BR90 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BR90 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BR90 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BR90 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BR90 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BR90 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BR90 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BR90 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BR90 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BR90 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8BR90 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BR90 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BR90 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BR90 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BR90 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BR90 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BR90 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BR90 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BR90 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BR90 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BR90 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BR90 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BR90 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BR90 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8BR90 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BR90 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BR90 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BR90 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BR90 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BR90 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BR90 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BR90 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BR90 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BR90 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BR90 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BR90 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BR90 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BR90 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BR90 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BR90 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BR90 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8BR90 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BR90 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BR90 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BR90 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BR90 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BR90 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BR90 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BR90 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BR90 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BR90 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BR90 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BR90 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BR90 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BR90 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8BR90 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms