Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNW9

Kbtbd11, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kbtbd11Q8BNW9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kbtbd11Q8BNW9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kbtbd11Q8BNW9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms