Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

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Length 718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gga3Q8BMI3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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