Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG7

Rab3gap2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap2Q8BMG7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab3gap2Q8BMG7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3gap2Q8BMG7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms