Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLK3

Lsamp, Limbic system-associated membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsampQ8BLK3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LsampQ8BLK3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LsampQ8BLK3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LsampQ8BLK3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LsampQ8BLK3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LsampQ8BLK3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LsampQ8BLK3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LsampQ8BLK3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LsampQ8BLK3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LsampQ8BLK3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LsampQ8BLK3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LsampQ8BLK3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LsampQ8BLK3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LsampQ8BLK3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LsampQ8BLK3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LsampQ8BLK3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LsampQ8BLK3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LsampQ8BLK3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms