Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp54Q8BL06 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp54Q8BL06 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms