Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atg4dQ8BGV9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg4dQ8BGV9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms