Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGR5

Fam53b, Protein FAM53B, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53bQ8BGR5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53bQ8BGR5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53bQ8BGR5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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