Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Vipas39Q8BGQ1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Vipas39Q8BGQ1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Vipas39Q8BGQ1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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Vipas39Q8BGQ1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
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