Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
U2af1l4Q8BGJ9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.32■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.32■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.31■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.3■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.3■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms