Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ubash3bQ8BGG7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms