Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8BGC1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8BGC1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8BGC1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8BGC1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8BGC1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8BGC1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8BGC1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms