Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG22

Clca2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca2Q8BG22 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clca2Q8BG22 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clca2Q8BG22 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms