Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfascQ810U3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms