Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc172Q810N9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc172Q810N9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc172Q810N9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms