Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Liat1Q810M6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Liat1Q810M6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms