Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cracr2bQ80ZJ8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cracr2bQ80ZJ8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cracr2bQ80ZJ8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms