Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Negr1Q80Z24 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Negr1Q80Z24 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms