Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rbbp8Q80YR6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8Q80YR6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms