Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kdm5bQ80Y84 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kdm5bQ80Y84 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm5bQ80Y84 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms