Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AknaQ80VW7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
AknaQ80VW7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AknaQ80VW7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms