Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cfap100Q80VN0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cfap100Q80VN0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cfap100Q80VN0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cfap100Q80VN0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cfap100Q80VN0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cfap100Q80VN0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cfap100Q80VN0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cfap100Q80VN0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cfap100Q80VN0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms