Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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Arhgef17Q80U35 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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Arhgef17Q80U35 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Arhgef17Q80U35 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Arhgef17Q80U35 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgef17Q80U35 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Arhgef17Q80U35 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Arhgef17Q80U35 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Arhgef17Q80U35 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef17Q80U35 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef17Q80U35 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef17Q80U35 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Arhgef17Q80U35 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef17Q80U35 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef17Q80U35 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgef17Q80U35 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Arhgef17Q80U35 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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