Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
NischQ80TM9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
NischQ80TM9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
NischQ80TM9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
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