Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClmQ7TSN2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmQ7TSN2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms