Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPN3

Pigv, GPI mannosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigvQ7TPN3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PigvQ7TPN3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms