Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim17Q7TPM3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim17Q7TPM3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms