Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HhipQ7TN16 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HhipQ7TN16 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms