Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMF2

Eri1, 3'-5' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri1Q7TMF2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eri1Q7TMF2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eri1Q7TMF2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eri1Q7TMF2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eri1Q7TMF2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eri1Q7TMF2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eri1Q7TMF2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eri1Q7TMF2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eri1Q7TMF2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms