Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vma21Q78T54 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms