Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim12Q78RX3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms