Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rph3alQ768S4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rph3alQ768S4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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