Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SynmQ70IV5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SynmQ70IV5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms