Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl35Q6ZWV7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl35Q6ZWV7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms