Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ino80Q6ZPV2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms