Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Znf653Q6YND2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf653Q6YND2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf653Q6YND2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf653Q6YND2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf653Q6YND2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf653Q6YND2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Znf653Q6YND2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf653Q6YND2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf653Q6YND2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf653Q6YND2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf653Q6YND2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf653Q6YND2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf653Q6YND2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms